>>которые нужно просто заблокировать от обновления, создав пустые файлы +IGNOREME в соответствующих каталогах базы данных установленных портов. Пресекать установку пакета libnotify-0.7.3 совместно с другими.
> С таким подходом вы рискуете:
> 1. иметь дырявый софт,

"Дырявое DE" — это из разряда "трухлявый рабочий стол"? :)

> 2. или не установить нужный софт, из-за того что он требует libnotify более свежей версии,

Всё устанавливается. Потом удаляю пакет libnotify-0.7.3 (он не конфликтует с устаревшим libnotify-0.5.2, они оба могут присуствовать, но работает только один при отсутствии второго) и ремонтирую базу (pkgdb -vfFu).

> 3. не установить нужный софт даже старой версии, которая требовала установленную у
> вас libnotify, потому что взять старую версию зачастую оказывается просто неоткуда,

Как, по-вашему, я установил Xfce 4.6.2? :) Дерево портов через CVS можно синхронизировать на любую дату. Я просто выбрал ту точку, когда Xfce 4.6.2 было стабилизированным, синхронизировал /usr/ports, собрал бинарные пакеты и сейчас у меня пакетная база из 28 архивов бинарных пакетов, относящихся к установке Xfce 4.6.2, которые смело можно ставить в современную FreeBSD. Критическая зависимость только одна — libnotify-0.5.2, без которой не будет работать нотификация (сообщения о возможности отсоединения флешки, о завершении закачки файлов в Midori и т.д.). И этот архив бинарного пакета у меня имеется "на всякий случай".

> что и требовалось доказать.

Ничего не доказал. Я объяснил, как у меня организовано.