Так-то оно так. Здорово, когда всё через pip затягивается. Но тут есть 2 момента.
Первый -- это то, что хорошо в теории не всегда так будет работать в практике. Реальные приложения среднего размера уже начинают требовать танцев с бубном, как тайга. В идеале разработчикам в этой ситуации нужно собирать свои репозитории для разных серверных дистрибутивов. Это не так просто, потому что их нужно поддерживать, обновлять воврем и тп. Это человекочасы, то есть дополнительные затраты. Ну и не очень красиво, когда ты в систему тянешь полностью свои библиотеки других версий. Это лишнее дублирование, но для энтерпрайс-коробки сойдёт.
Второй -- по факту, если ты делаешь обёртку над библиотеками сторонних разработчиков, то зависишь от этих разработчиков. А если у них в сишной библиотеке течёт память, а они её не фиксят? Придётся это в конечном счёте делать за них. А это уже необходимость иметь разработчиков на другие языки. И хорошо, если сторонние разработчики вообще не будут твои пул-реквесты игнорировать.